ຜະລິດຕະພັນ

ການສຶກສາ immunoprecipitation chromatin ກວ້າງ genome (ChIP) ໄດ້ນໍາເອົາຄວາມເຂົ້າໃຈອັນສໍາຄັນເຂົ້າໄປໃນທ້ອງຖິ່ນຂອງ genomic ຂອງທາດໂປຼຕີນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ chromatin ແລະການດັດແປງ histone.ຈໍານວນຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງຂໍ້ມູນທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍການວິເຄາະເຫຼົ່ານີ້, ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີວິທີການທີ່ຊ່ວຍໃຫ້ມີການກວດສອບຄວາມຖືກຕ້ອງຢ່າງໄວວາແລະການວິເຄາະຄວາມກ່ຽວຂ້ອງທາງຊີວະພາບ.ຍິ່ງໄປກວ່ານັ້ນ, ຍັງມີທາດໂປຼຕີນແລະເປົ້າຫມາຍການປ່ຽນແປງທີ່ຍາກທີ່ຈະກວດພົບໂດຍໃຊ້ວິທີການມາດຕະຖານຂອງ ChiP.ເພື່ອແກ້ໄຂບັນຫາເຫຼົ່ານີ້, ພວກເຮົາໄດ້ພັດທະນາຂັ້ນຕອນການ immunoprecipitation chromatin ທັນທີທີ່ພວກເຮົາເອີ້ນວ່າ ZipChip.ZipChip ຫຼຸດລົງເວລາຢ່າງຫຼວງຫຼາຍແລະເພີ່ມຄວາມອ່ອນໄຫວເພື່ອໃຫ້ມີການກວດສອບຫຼາຍ loci ຢ່າງໄວວາ.ໃນທີ່ນີ້ພວກເຮົາອະທິບາຍວິທີການ ZipChIP ຊ່ວຍໃຫ້ການກວດສອບການດັດແປງ histone (H3K4 mono- ແລະ trimethylation) ແລະສອງເຊື້ອລາ histone demethylase, Jhd2 ແລະ Rph1, ເຊິ່ງກ່ອນຫນ້ານີ້ມີຄວາມຫຍຸ້ງຍາກໃນການກວດສອບໂດຍໃຊ້ວິທີການມາດຕະຖານ.ນອກຈາກນັ້ນ, ພວກເຮົາສະແດງໃຫ້ເຫັນຄວາມຄ່ອງຕົວຂອງ ZipChIP ໂດຍການວິເຄາະການເສີມສ້າງຂອງ histone deacet ylase Sir2 ຢູ່ heterochromatin ໃນເຊື້ອລາແລະການເສີມສ້າງຂອງ chromatin remodeler, PICKLE, ຢູ່ euchromatin ໃນ Arabidopsis thaliana.