ຜະລິດຕະພັນ

topology ເຍື່ອຂອງໂດເມນຊ່ອງ colicin E1 ໄດ້ຖືກສຶກສາໂດຍການຖ່າຍທອດພະລັງງານ fluorescence resonance (FRET).The FRET ກ່ຽວຂ້ອງກັບອາຊິດ fluorescent ທີ່ເຂົ້າລະຫັດພັນທຸກໍາ (coumarin) ເປັນຜູ້ໃຫ້ທຶນແລະສານຕົກຄ້າງ cysteine ​​ທີ່ຖືກຕິດສະຫຼາກທີ່ຖືກຄັດເລືອກດ້ວຍ DABMI (4-(dimethylamino)phenylazophenyl-4'-maleimide) ເປັນຜູ້ຮັບ FRET.ການຕົກຄ້າງຂອງ fluorescent coumarin ໄດ້ຖືກລວມເຂົ້າໄປໃນທາດໂປຼຕີນໂດຍຜ່ານຄູ່ສັງເຄາະ orthogonal tRNA/aminoacyl-tRNA ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ການລວມເອົາການຄັດເລືອກເຂົ້າໄປໃນສະຖານທີ່ໃດໆພາຍໃນໂດເມນຊ່ອງ colicin.ແຕ່ລະຕົວແປໄດ້ເກັບຮັກສາການກາຍພັນທີ່ຢຸດ (TAG) ສໍາລັບການລວມຕົວຂອງ coumarin ແລະການກາຍພັນຂອງ cysteine ​​(TGT) ສໍາລັບການຕິດຄັດ DABMI.ຫົກໄລຍະຫ່າງລະຫວ່າງກັນພາຍໃນ helices 1-6 ໄດ້ຖືກກໍານົດໂດຍໃຊ້ການວິເຄາະ FRET ສໍາລັບທັງສອງລັດທີ່ລະລາຍແລະເຍື່ອຫຸ້ມ.ຂໍ້ມູນ FRET ສະແດງໃຫ້ເຫັນການປ່ຽນແປງຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງໄລຍະຫ່າງ interhelical ໃນບັນດາ helices 3-6 ຕາມສະມາຄົມເຍື່ອສະຫນອງຄວາມເຂົ້າໃຈໃຫມ່ກ່ຽວກັບໂຄງສ້າງເຍື່ອຫຸ້ມຂອງໂດເມນຊ່ອງທາງ.ໂດຍທົ່ວໄປ, ປະສິດທິພາບ interhelical coumarin-DABMI FRET ຫຼຸດລົງຕາມການຜູກມັດເຍື່ອ, ການສ້າງແບບຈໍາລອງ umbrella ສໍາລັບຊ່ອງທາງ colicin.ຮູບແບບທີ່ຄົງຕົວສໍາລັບສະຖານະປິດຂອງໂດເມນຊ່ອງໄດ້ຖືກພັດທະນາໂດຍອີງໃສ່ຂໍ້ມູນ FRET ປະຈຸບັນແລະກ່ອນຫນ້ານີ້ທີ່ຈັດພີມມາ.ຮູບແບບແນະນໍາການຈັດລຽງເປັນວົງຂອງ helices 1-7 ໃນທິດທາງຕາມເຂັມໂມງຈາກຂ້າງ extracellular ແລະສະມາຄົມ interfacial membrane ຂອງ helices 1, 6, 7, ແລະ 10 ປະມານ hairpin ສູນກາງ transmembrane ສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໂດຍ helices 8 ແລະ 9.